Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ctu1Q99J10 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ctu1Q99J10 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctu1Q99J10 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctu1Q99J10 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms