Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfdQ925I7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfdQ925I7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfdQ925I7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfdQ925I7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms