Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Traf7Q922B6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Traf7Q922B6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf7Q922B6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms