Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TardbpQ921F2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TardbpQ921F2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TardbpQ921F2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms