Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sh2b1Q91ZM2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2b1Q91ZM2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2b1Q91ZM2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2b1Q91ZM2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sh2b1Q91ZM2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2b1Q91ZM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2b1Q91ZM2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms