Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snapc2Q91XA5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snapc2Q91XA5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snapc2Q91XA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Snapc2Q91XA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms