Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmco4Q91WU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmco4Q91WU4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmco4Q91WU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms