Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tdrd3Q91W18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tdrd3Q91W18 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tdrd3Q91W18 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms