Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itm2cQ91VK4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itm2cQ91VK4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itm2cQ91VK4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms