Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Crb1Q8VHS2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Crb1Q8VHS2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Crb1Q8VHS2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Crb1Q8VHS2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Crb1Q8VHS2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Crb1Q8VHS2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms