Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SnrkQ8VDU5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SnrkQ8VDU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SnrkQ8VDU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms