Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Snap47Q8R570 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snap47Q8R570 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snap47Q8R570 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snap47Q8R570 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms