Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sf3b4Q8QZY9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sf3b4Q8QZY9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sf3b4Q8QZY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.7 ms