Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OptnQ8K3K8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
OptnQ8K3K8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
OptnQ8K3K8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
OptnQ8K3K8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms