Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Paf1Q8K2T8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Paf1Q8K2T8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Paf1Q8K2T8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Paf1Q8K2T8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms