Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scara5Q8K299 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Scara5Q8K299 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scara5Q8K299 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.5 ms