Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Abcf3Q8K268 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Abcf3Q8K268 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms