Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Spire2Q8K1S6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Spire2Q8K1S6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Spire2Q8K1S6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms