Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Cldn34c1Q8K193 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Cldn34c1Q8K193 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Cldn34c1Q8K193 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn34c1Q8K193 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Cldn34c1Q8K193 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Cldn34c1Q8K193 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Cldn34c1Q8K193 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn34c1Q8K193 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cldn34c1Q8K193 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Cldn34c1Q8K193 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn34c1Q8K193 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Cldn34c1Q8K193 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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