Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmbrd1Q8K0B2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmbrd1Q8K0B2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lmbrd1Q8K0B2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms