Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rasgef1bQ8JZL7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms