Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Celf3Q8CIN6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Celf3Q8CIN6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Celf3Q8CIN6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Celf3Q8CIN6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms