Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cog3Q8CI04 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cog3Q8CI04 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cog3Q8CI04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms