Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rftn2Q8CHX7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rftn2Q8CHX7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rftn2Q8CHX7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms