Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CF25 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q8CF25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q8CF25 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q8CF25 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CF25 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CF25 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CF25 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CF25 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8CF25 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8CF25 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8CF25 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8CF25 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8CF25 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8CF25 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8CF25 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8CF25 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CF25 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CF25 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms