Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc113Q8C5T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc113Q8C5T8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc113Q8C5T8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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