Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc169Q8BXX9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc169Q8BXX9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc169Q8BXX9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms