Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trerf1Q8BXJ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Trerf1Q8BXJ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trerf1Q8BXJ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trerf1Q8BXJ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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