Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Als2cr12Q8BVM7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Als2cr12Q8BVM7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Als2cr12Q8BVM7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Als2cr12Q8BVM7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Als2cr12Q8BVM7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Als2cr12Q8BVM7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Als2cr12Q8BVM7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Als2cr12Q8BVM7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms