Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY8

Scfd2, Sec1 family domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scfd2Q8BTY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scfd2Q8BTY8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scfd2Q8BTY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scfd2Q8BTY8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scfd2Q8BTY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms