Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup54Q8BTS4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nup54Q8BTS4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup54Q8BTS4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms