Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rd3Q8BRE0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rd3Q8BRE0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rd3Q8BRE0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms