Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Usp54Q8BL06 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Usp54Q8BL06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Usp54Q8BL06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Usp54Q8BL06 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms