Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcfc2Q8BKT3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcfc2Q8BKT3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcfc2Q8BKT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms