Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fbxo28Q8BIG4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fbxo28Q8BIG4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo28Q8BIG4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms