Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf41Q8BH75 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf41Q8BH75 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf41Q8BH75 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 223.3 ms