Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pknox2Q8BG99 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pknox2Q8BG99 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pknox2Q8BG99 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pknox2Q8BG99 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms