Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rusc2Q80U22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rusc2Q80U22 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Rusc2Q80U22 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rusc2Q80U22 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Rusc2Q80U22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms