Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vat1lQ80TB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vat1lQ80TB8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vat1lQ80TB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms