Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sgo2Q7TSY8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sgo2Q7TSY8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sgo2Q7TSY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms