Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RgmbQ7TQ33 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RgmbQ7TQ33 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RgmbQ7TQ33 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RgmbQ7TQ33 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms