Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Prrc2bQ7TPM1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Prrc2bQ7TPM1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Prrc2bQ7TPM1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Prrc2bQ7TPM1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Prrc2bQ7TPM1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms