Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pkd1l2Q7TN88 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkd1l2Q7TN88 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd1l2Q7TN88 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms