Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smap2Q7TN29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smap2Q7TN29 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smap2Q7TN29 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms