Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcl2Q78Y63 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdcl2Q78Y63 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdcl2Q78Y63 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms