Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp34Q6ZQ93 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp34Q6ZQ93 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp34Q6ZQ93 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp34Q6ZQ93 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms