Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efr3bQ6ZQ18 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efr3bQ6ZQ18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Efr3bQ6ZQ18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Efr3bQ6ZQ18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efr3bQ6ZQ18 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Efr3bQ6ZQ18 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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