Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ift172Q6VH22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ift172Q6VH22 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ift172Q6VH22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ift172Q6VH22 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms