Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bnip1Q6QD59 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bnip1Q6QD59 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Bnip1Q6QD59 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms