Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Garem2Q6PAJ3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Garem2Q6PAJ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Garem2Q6PAJ3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Garem2Q6PAJ3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Garem2Q6PAJ3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms